农业种植基地办证需要先确定种植地的用途，然后在当地农业行政部门申请办理相关证件，如土地使用证、种植许可证等。同时，还需要完成相关的环保、质量检测、防疫等问题，并经过相关部门的验收。

办证流程比较繁琐，需要提前做好充分的准备工作，并逐一完成办理手续，以确保基地的合法性和安全性。