于谦的结局是被冤杀。朱祁镇即眀英宗，在土木堡之变被瓦剌俘虏，于谦等拥立明景帝，并打退瓦剌军。

朱祁镇回到明朝后，被明景帝软禁，景帝死后，朱祁镇复位，杀害了北京保卫战的功臣于谦。