孔姓的祖籍位于今天的山东省曲阜市。孔子的祖先原籍宋国栗邑（今河南省商丘市夏邑县），但他的家族后来迁徙到了鲁国陬邑（今山东省曲阜市）。孔子本人也是出生于此地，并在此地主持过文化和学术事务。因此，可以说孔姓的祖籍是在山东曲阜。