在决定网上购物时选择厂家配送还是自营店，需要考虑以下几个因素：

商品正品性：

厂家配送的商品通常是正品，因为京东会对厂家进行资质审核和商品质量检查1。

自营商品由京东直接采购并销售，品质和售后服务可以得到保障1。

价格：

厂家配送商品通常价格更低，因为减少了商品的流通环节1。

自营商品的物流成本通常由京东承担，可能会有额外的物流成本2。

发货速度：

厂家配送商品通常发货更快，因为商品直接从厂家发出1。

自营商品的物流信息实时更新，方便用户查询3。

售后服务：

厂家配送商品的售后服务可能不如自营商品，因为需要与厂家沟通协调3。

自营商品的售后服务由京东直接提供，包括7天无理由退换货、30天质量保障等3。

综上所述，如果您追求更低的价格和更快的发货速度，厂家配送可能是一个不错的选择。但是，如果您更看重商品的品质保证和完善的售后服务，自营商品将是更好的选择。在选择时，您应该根据自己的需求和偏好来决定。