论文中的引用标记通常**不会直接影响查重的结果**，但正确的引用格式可以帮助查重系统正确识别引用内容。

在论文中，引用应该分为直接引用和间接引用。直接引用是指将所引用的文献原文不动地复制到自己的文章中，并在文中使用交叉引用的方式进行标注。这样做的话，查重系统在检测时会将标注的原文与你写的文字进行对比，如果一致，系统通常会将其识别为引用，并在查重报告中以绿色标出。然而，需要注意的是，不同的学校或机构可能对查重的标准有所不同，有些学校可能不仅仅关注去除引用后的复制比，而是看总复制比，这意味着即使引用被正确标注，也可能会计入总的重复率中。

此外，引用的格式非常重要，如果引用格式不正确，或者原文没有适当修改，那么即使是标注了引用的部分也可能被查重系统判定为抄袭。因此，确保引用格式正确并且遵循学术规范是避免查重问题的关键。

总之，虽然引用标记本身不会影响查重结果，但是正确的引用格式和标注对于查重系统能否正确识别引用内容至关重要。为了避免不必要的麻烦，建议在撰写论文时严格遵守相关的引用规范，并在提交前仔细检查引用格式。同时，了解所在学校或机构的查重标准也是非常重要的。