南港车站网上改签流程大致如下：首先登录台铁官网进入“车票预订”界面，选择“我的车票”并输入订单号和身份证号码进行验证。

找到需要改签的车票订单后，选择“改签”按钮并根据提示进行操作。选择新的车次和席别，然后支付差价（如果有）。

最后，确认改签信息并提交。如果成功，就可以在“我的车票”页面上看到新的车票信息。需要注意的是，改签截止时间为开车前一小时，且只能改签一次。