当男友告诉你他莫名的肚子疼时，首先要表达你的关心和理解。你可以这样回复：

“亲爱的，听说你肚子疼，我真的很担心。现在感觉怎么样了？需要我做些什么吗？”

这样的回复表达了你的关心，同时也询问了他的状况，给了他一个机会告诉你他需要什么帮助。如果他需要进一步的关心或建议，你可以继续问：

“是不是吃错了什么东西？要不要喝点热水或者吃点药？”

如果他需要更具体的建议，比如去医院看医生，你可以说：

“如果疼痛持续或者加重，我建议你去医院看看医生，确保没有什么大问题。我会陪你去的，别担心。”

最重要的是，让他知道你在他身边支持他，让他感到温暖和安全。