三年新农合不能完全顶一年职工医保。虽然新农合和职工医保都是国家基本医疗保险制度，但是它们的缴费标准、报销比例、报销范围等方面存在差异。

新农合主要面向农村居民，缴费标准相对较低，报销比例也相对较低。而职工医保主要面向城镇职工，缴费标准相对较高，报销比例也相对较高。因此，即使交了三年的新农合，也不能等同于一年的职工医保在报销比例和保障范围等方面的待遇。

此外，职工医保还有个人账户等优势，可以用于日常购药、门诊等支出。而新农合则没有个人账户，只能在定点医疗机构使用。

因此，即使已经交了三年的新农合，如果想要获得更高水平的医疗保障，还是需要继续缴纳职工医保或者选择其他的商业医疗保险。