如果加油站员工遇到跑单且无法看清车牌的情况，可以采取以下措施：

立即记录：尽可能快地记下车辆的特征，如颜色、型号、品牌等，以及司机的外貌特征。

查看监控：调取加油站的监控录像，看是否能获取到更清晰的车牌信息或车辆其他特征。

报警处理：向当地警方报案，提供所掌握的信息，让警方协助查找车辆和车主。

内部记录：在加油站内部建立跑单记录，包括日期、时间、车辆描述等，以备后续调查使用。

加强防范：采取措施防止类似情况再次发生，如增加提示标识、加强员工培训等。

团队合作：与其他加油站员工分享此情况，以便他们提高警惕。

最重要的是，保持冷静并尽快采取行动，同时，加油站可以考虑安装更先进的车牌识别系统，以便更好地应对这种情况。