臭豆腐长红毛是由红曲霉菌（Monascus spp.）引起的。这是一种发酵食品中常见的真菌，也被用来制作红曲米酒、红米酵素等食品添加剂。红曲霉菌在发酵过程中会分泌红色素，臭豆腐长出的红毛就是因为这种色素的存在。然而，红曲霉菌也会产生亚硝酸盐和黄曲霉毒素等有害物质，因此臭豆腐在制作过程中需要严格卫生管理。