两层复式楼的优点是空间利用率高，可以充分利用上下两层的空间，增加居住面积。同时，两层复式楼的布局更加灵活，可以根据个人需求进行设计和改造。此外，两层复式楼通常拥有独立的入口和私密性较高的生活空间，能够提供更好的居住体验。

然而，两层复式楼也存在一些缺点。首先，楼层之间的楼梯会占用一定的空间，可能会减少一层的实际使用面积。其次，楼层之间的隔音效果可能不如独立的单层住宅，可能会受到楼上楼下的噪音干扰。此外，两层复式楼的建造成本较高，维护和装修也相对复杂。最后，对于老年人或行动不便的人来说，上下楼可能会不太方便。