根据《工伤保险条例》规定，工伤认定中的劳动能力鉴定，应当自受理工伤认定申请之日起60日内做出。对有争议的工伤认定，劳动争议仲裁委员会应当自受理仲裁申请之日起45日内做出仲裁决定。因此，重庆5级工伤赔偿仲裁的总时长一般不会超过105个工作日。但具体时长还取决于案件的复杂程度，以及仲裁委员会的工作效率等因素。