《神奇校车》第一辑共13集，每集约25分钟。它们分别是：“神奇校车之明星之旅”、“神奇校车之骨骼探险之旅”、“神奇校车之圣诞之旅”、“神奇校车之细胞实验之旅”、“神奇校车之动物世界之旅”、“神奇校车之旅入人体”、“神奇校车之降雨的起源”、“神奇校车之太阳系的旅程”、“神奇校车之心脏及循环系统之旅”、“神奇校车之海底探险之旅”、“神奇校车之生命的适应之旅”、“神奇校车之蓝色海洋之旅”，以及“神奇校车之岩石、岩壁和石头之旅”。每集中我们能够看到一群小学生跟随着她们的老师，驶向不同的目的地，探索不同领域的科学知识，如细胞、动物、天文等。这部动画具有趣味性、知识性以及启发性。