农业银行卡如果长期不用，不会自动注销，但卡内余额可能会受到年费等一些扣费的影响，逐渐减少，直到被扣空。建议您在长时间内不使用农业银行卡时，可以将其存放在安全可靠的地方，或使用一些活动或小额消费，保持卡内余额不为零，以避免一些意外情况。

如果长期不使用过久，可能会被评定为休眠账户，涉及到恢复账户需要的手续及时间问题。