在《星穹铁道》中，女主的身份暴露主要经历了以下几个关键步骤：

初次显露：女主在某些关键事件中展现了与众不同的能力或知识，引起了周围人的注意。

深入调查：随着故事的发展，一些角色开始深入调查女主的背景，试图揭开她的真实身份。

关键事件：某个关键事件的发生，如与敌对势力的交锋，使得女主不得不使用她的真实能力，从而直接暴露了自己的身份。

身份揭示：在经历了一系列的事件和冲突后，女主的身份最终被彻底揭示，引起了广泛的关注和讨论。

整个过程中，女主的身份暴露不仅是故事情节发展的需要，也与其个人成长和与其他角色的关系发展密切相关。

这样的设计不仅增加了故事的戏剧性，也使得女主的角色更加立体和丰满。

以上只是大致的概述，具体的情节可能会根据作者的创作和故事的发展有所不同。