房产证满三年的过户费计算方法如下：

首先，需要缴纳契税，这通常是房子过户价格的1%到3%。具体的税率取决于房屋的具体情况，例如房屋的面积和是否是首套房屋。其次，需要支付增值税，这通常是按照房子两次交易差价的5.6%来支付。如果房产证已满五年，则可以免交增值税。最后，还需要考虑个人所得税，这通常是房子过户价格的1%或者两次交易价差的20%，但如果房子是卖家满五年的唯一住房，则可以免交个人所得税。

以上信息仅供参考，具体费用可能会因地区和具体情况而有所不同，建议咨询相关部门或律师进行确认。