高铁G1和G3是中国境内的两个高速列车线路，它们之间有以下的区别：

路线不同：G1和G3的起点和终点不同。G1线路从北京南站始发，途经天津南站、济南西站、南京南站、上海虹桥站，最终到达杭州东站。G3线路从北京西站始发，途经太原南站、郑州东站、武汉站、长沙南站、南昌西站、上海虹桥站，最终到达广州南站。

运营公司不同：G1和G3的运营公司也不同。G1由中国铁路北京局集团有限公司负责运营，G3由中国铁路武汉局集团有限公司负责运营。

运营时间不同：G1和G3的运营时间也略有不同。G1在北京南站的首班车是早上6:43，末班车是晚上21:28；G3在北京西站的首班车是早上7:00，末班车是晚上21:30。

列车类型不同：G1和G3的列车类型也有所不同。G1线路上的列车类型包括高速动车组和普通动车组，而G3线路上的列车类型只有高速动车组。

总的来说，虽然G1和G3都是中国高速列车线路，但它们的路线、运营公司、运营时间和列车类型等方面都有所不同。