根据香港入境处的规定，逗留超过许可期限的外国人将被视为非法居留，可能面临罚款、拘留和驱逐出境等处罚。具体的处罚方式取决于个人情况和逾期逗留的时间长度。因此，对于在香港逗留三个月内超时的外国人，可能会面临罚款和强制驱逐出境的处罚。建议外国人在逗留期限内合法地履行入境手续，并在需要延期逗留时提前办理相关手续，以避免不必要的法律风险。