门诊包干和门诊直接结算主要区别是属性不同：门诊包干是指患者在外地就医时，由医保机构按照医保规定的费用标准，按照实际发生的费用，按照一定的比例承担患者的费用，患者只需支付自费部分。

而门诊结算则是指患者在就诊时，由医保机构按照医保规定的费用标准，按照实际发生的费用，按照一定的比例承担患者的费用，患者只需支付自费部分，并在就诊结束后，由医保机构进行结算，患者只需支付自费部分。