根据中国的《工伤保险条例》规定，工伤是指在工作时间和工作岗位上，因工作原因受到的伤害和疾病。而超长夜班加班疲劳导致骑电动车摔伤，如果能够证明这是在工作时间和工作岗位上发生的，且是由于工作原因导致的，那么这种情况应该算作工伤。

然而，具体是否能够认定为工伤，还需要根据具体情况进行分析和判断。例如，需要考虑员工是否处于工作状态、工作强度是否过大、电动车是否属于工作工具等因素。如果员工在非工作时间、非工作岗位上发生意外伤害，即使是因为工作原因导致的，也不应认定为工伤。

总之，超长夜班加班疲劳导致骑电动车摔伤是否算作工伤，需要根据具体情况和证据进行判断。如果员工遇到这种情况，建议及时向企业或工伤保险机构申请工伤认定，并提供相关证据和材料，以便得到合理的赔偿和保障。