根据保险合同所规定的条款，如果宝马5系车辆在水中发生故障或熄火，可以申请车辆损失险进行理赔。

如果保险合同中有附加水淹险，则可以申请该附加险种进行理赔。

通常情况下，保险公司会派出专业人员对车辆进行评估，然后按照实际损失进行理赔。

除此之外，如果车主在事故发生后立即联系保险公司，可以获得更多的帮助和支持。

值得提醒的是，车主应该在购买保险时仔细阅读保险条款，了解自己的保险权益和责任，以便在需要理赔时可以得到更好的保护。

此外，车主在行驶过程中要时刻注意道路环境和车辆状况，避免车辆出现故障或事故，保障驾驶安全。