止水螺杆防水的做法首先需要将止水螺杆和防水卷材分别准备好。然后，在施工现场，将止水螺杆按照设计要求固定在建筑结构中，保证止水螺杆与建筑材料牢固结合。

接着，将防水卷材铺设在止水螺杆周围，并采用焊接、贴合等方式进行连接。同时，要保证防水卷材与止水螺杆、墙体材料等之间的密封性，最终形成一个完整的防水层。整个过程需要严格按照规范操作，确保防水效果和施工质量。