医院住院三天以后才报医保的原因有很多，主要有以下几点：

首先，由于医保的审核制度较为严格，需要对患者的病情进行全面的评估，因此医院需要等待较长的时间进行诊疗和观察，以确保向医保方面报销的准确性和合法性。

其次，患者的病情和治疗费用也需要时间来确定，因此医院需要等待有关报销的一些处理，例如预算核定、费用结算等环节完成后才能进行报销。

此外，医院也需要进行一些收费、归口等流程，以确保医疗服务的正常进行。

因此，医院住院三天以后才报医保是基于多种原因考虑到的决策，也是为了保障医患双方的利益和医疗服务的正常运行。