是的，黄牌货车在路边违章停车是会被扣分的。根据《道路交通安全法》相关规定，黄牌货车的交通违法行为将被记入驾驶人的个人驾驶证，同时扣除相应的交通违法记分。

因此，如果黄牌货车在路边违章停车，不仅会被罚款，而且还将扣除相应的交通违法记分，对驾车人的驾驶证和信用记录都会产生不良影响。为了避免被扣除驾照分数，驾车人需要严格遵守交通法规，避免违章停车等交通违法行为。