菜市场上卖的豆腐通常不是转基因的。豆腐是一种传统的食品，使用的是豆类原料，如黄豆、绿豆、黑豆等，这些豆类原料都是天然的，没有经过转基因改造。虽然现在有一些转基因的大豆品种，但是它们通常不会用于豆腐的制作，因为转基因大豆的蛋白质含量较低，不适合豆腐的制作。