车管所体检色盲未通过会被记录在您的体检档案中，这是为了维护驾驶安全和遵守交通规则的需要。这些记录可能会被保留在交通警察部门和车辆管理部门的数据库中，在进行职业和驾驶执照审批和评估时起到重要的作用。

因此，建议申请人在进行体检前自行进行色盲测试，并如实披露自己的身体状况，以保证自身和他人的安全。