南通农保急诊可以通过以下步骤进行报销：

首先，患者需要带上身份证、医保卡等相关证件到医院急诊部门就诊，并向医院提交医疗保险报销申请。

然后，医院会进行诊断和治疗，并开具相关的医疗费用清单。

最后，患者需要将医疗费用清单等相关材料提交给当地的医保局，申请医疗保险报销。医保局会根据相关规定进行审核，并将符合条件的医疗费用进行报销。