柴犬的最佳配对时间应该在母犬第一次发情后的第二个或第三个周期，即通常在母犬1岁到2岁之间。这样做可以确保母犬已经成熟并且身体已经准备好进行繁殖，同时也可以避免过早或过晚繁殖带来的健康问题。