如果员工在工作中受伤，没有入工伤保险只有商业险，公司应该立即联系商业保险公司进行理赔申请。

如果保险公司确认该事故属于工伤范畴，按照商业保险合同约定进行赔付，如有医疗费用、误工补偿等费用，应尽快报销。

如果保险公司认定该事故不属于工伤，公司可以与员工协商解决，如提供适当的补偿或赔偿。对于员工来说，建议尽快寻求法律援助，确保自身权益得到保障。