绿竹翁自废武功的原因是因为他被圣姑责罚，且这个过程发生在圣姑喜欢上了令狐冲的背景下。

圣姑对令狐冲情有独钟，但令狐冲对圣姑的求爱表现出明显的抗拒。圣姑因此对令狐冲生出嫌隙，对他不再像以前那样欢迎。绿竹翁是圣姑的师父，他为了平息圣姑的怨气，故意把令狐冲不愿接受圣姑的消息散步出去。然而，这并没有改变圣姑的态度，反而使她更加执迷不悟。

最后，为了表示悔过，绿竹翁自废武功，以示对圣姑的歉意。