重庆农村自建房翻建的规定如下：

宅基地面积标准：根据《重庆市土地管理规定》，市区范围内村民宅基地标准为每人20至25平方米，其他区县（自治县、市）范围内村民宅基地标准为每人20至30平方米。3人以下户按3人计算，4人户按4人计算，5人以上户按5人计算。因此，如果户籍人口为3人，翻建后的宅基地面积上限为75平方米（市区范围内）或90平方米（其他区县）。

房屋层数限制：根据《重庆市人民政府办公厅关于印发重庆市农村村民住宅规划建设管理的暂行办法的通知》，农村村民住宅原则上不得超过三层。因此，宅基地建住宅的层数不得超过三层。

审批手续：不论是新建还是翻新，都需要经过当地主管部门的审批，获得宅基地使用权、建设用地许可、施工许可等证件后，才可以进行翻盖新房。未经审批手续私自翻盖房屋，属于违法建筑。

宅基地审批条件：宅基地审批有相关条件，其中“一户一宅”是最基本的条件。如果不符合这些条件，未来想在老屋翻盖新房，就不符合规定。

房屋安全：根据《农村住房建设技术政策》，农村房屋布局分为垂直分房（建筑层数2~3层）和水平分户（4~5层），每层高度不得超过3.3米。如果翻盖的楼层和高度超过相关规定，就会存在很大的危险性，房屋也可能面临着被拆掉的风险。

产权归属：因为继承、分户等原因导致的原房屋产权归属存在争议的，需要在翻盖前明确产权，消除争议，否则这样的房屋不能翻盖成新房。

以上信息仅供参考，具体的翻建规定可能会因地区和政策的不同而有所差异。建议在进行农村自建房翻建前，咨询当地政府或相关部门，了解具体的规定和要求，以确保合法合规地进行翻建。