大蒜出现棉花蒜的原因有两个:一个原因是氮肥太多，钾磷等元素缺乏。所以种大蒜应当氮磷钾等元素要搭配使用，不能单一使用某一种化肥，特别是氮肥如尿素。

第二个原因是水分太大，春季水浇的太勤，或连绵雨水排不出去。此两个原因造成了棉花蒜。