在确权过程中，房屋的高度并不是绝对的限制因素。如果房屋的所有权证明文件齐备，屋主可以通过提交相关材料以及房屋缩影等资料进行确权，房屋高度并不影响此过程。

然而，如果房屋高度超过了当地建筑法规的规定，屋主需要先办理有关的手续，确保房屋的合法性。

因此，在确权前，屋主需要仔细了解当地的相关规定，确保房屋的合法性，并准备好需要提交的证明文件，以完成确权程序。