如果7岁的女儿半夜醒来发现爸爸不在并因此报警，这是一个需要妥善处理的情况。以下是一些建议的处理步骤：

保持冷静和安抚孩子：首先，母亲或其他监护人要迅速赶到孩子的房间，保持冷静，安抚孩子的情绪，告诉她不要害怕，爸爸可能只是暂时不在。

了解具体情况：询问孩子是否知道爸爸去了哪里，是否有听到任何声音或看到什么异常。这有助于判断爸爸是否只是临时离开，还是有其他情况。

与爸爸取得联系：尝试通过手机或其他方式联系爸爸，确认他的位置和状况。如果爸爸是因为有紧急事情临时离开，并且现在安全，那么可以告诉孩子这个信息，让她放心。

与警方沟通：如果联系不上爸爸，或者感觉情况有异常，那么应该与警方保持沟通，提供爸爸的信息，让他们协助查找。同时，告诉警方这是一个可能的误会，以免浪费警力。

加强家庭安全措施：在确认孩子安全后，考虑加强家庭安全措施，比如安装报警系统，确保门窗锁好等。同时，也可以教育孩子一些基本的自我保护知识。

后续跟进与沟通：无论结果如何，都应该在事后与孩子进行沟通，解释清楚事情的原委，让她明白这只是一个误会或特殊情况，不是常态。同时，也要关注孩子的心理状态，确保她没有因此受到过多的惊吓或影响。

总之，面对这种情况，最重要的是保持冷静，确保孩子的安全，并尽快与警方和家庭成员取得联系，以便妥善处理。