南京电动车失火的原因有多种，其中包括非法改装锂电池、违规充电、电池故障以及使用非国标锂电池等。

非法改装锂电池可能导致速度和续航突破上限，从而引发安全隐患。违规充电，如在室内或楼道中充电，也可能导致火灾。此外，电池故障或使用非国标锂电池也是引发火灾的原因之一。