旋挖桩遇到卵石层时，需要采用合适的方法进行处理。首先，可以考虑进行钻探探测，确定卵石层的厚度和位置，然后在预制桩孔上进行凿岩，除去卵石层，再进行打桩。

另外，在旋挖桩施工前，可以先进行表土去除，再进行挖掘，以减少卵石对旋挖桩的影响。无论采用哪种方式，施工过程中需要严格控制挖掘深度和桩孔直径，确保桩的质量和稳定性。